Acerca de
Descripción
El curso proveerá una base teórica y práctica para el estudio de relaciones estructura-función de proteínas utilizando herramientas bioinformáticas. Se introducirán bases de datos y herramientas que permiten identificar dominios funcionales de proteínas, predecir la estructura de proteínas a partir de la secuencia, discernir regiones plegadas y flexibles de proteínas y analizar diferentes tipos de interacciones proteína-proteína. Se introducirá el uso de los algoritmos AlphaFold y Boltz para la predicción de estructura e interacciones proteína-proteína y proteína-ligando y de herramientas de IA para el diseño de novo de proteínas. A lo largo de los trabajos prácticos, los alumnos adquirirán manejo de herramientas de visualización y análisis de estructura y secuencia de proteínas utilizando los programas Chimera y Jalview.
El curso está dirigido a estudiantes avanzados de grado, estudiantes de doctorado y postdocs/investigadores con formación experimental que deseen adquirir conceptos de bioinformática estructural, y a alumnos con formación bioinformática que no tengan conocimientos previos de estructura-función de proteínas. Los alumnos podrán aplicar estas herramientas a sus temas de estudio durante la cursada.
Requisitos
- El curso no requiere formación bioinformática previa o conocimientos previos de programación.
- Se recomienda contar con conocimientos básicos de bioquímica/función de proteínas y manejo básico de computadoras.
- Algunos trabajos prácticos usan notebooks en Colab por lo que es necesario tener una cuenta de gmail.
Alumnos de Grado de Licenciatura de Biotecnología de UNSAM
Correlativa: Bioquímica de Proteínas
Tipo de Curso
- Curso de posgrado
- Materia optativa de grado (UNSAM)
Modalidad del curso
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Modalidad: Híbrida
- Alumnos UNSAM, CABA/AMBA: Presencial
- Otras regiones: Virtual
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Horas de cursada: 80 hs
- Evaluación: Individual mediante examen/trabajo final
Horarios
- Cursada: Martes 7 de Abril al Jueves 11 de Junio
- Teóricos y Prácticos: Martes y Jueves de 9 a 13hs.
- Cronograma completo: Próximamente
Asistencia
- Teóricas: Asistencia opcional (recomendada)
- Prácticas: Trabajos Prácticos (9 Trabajos prácticos, deberán asistir a 8 como mínimo)
- Evaluación Final: Asistencia obligatoria.
Evaluación
La evaluación final consistirá en la elaboración de un trabajo especial/seminario a definir durante la cursada que será presentado en forma escrita y oral. La evaluación será realizada por los docentes del curso.