Contenidos
Programas
Programa Teórico resumido
- Bases de Datos de Proteínas: Uniprot (Swissprot, Trembl), Interpro, PDB, PFAM.
- Estructura de Proteínas y relaciones estructura-función.
- Modelado por Homología y predicción de la estructura de proteínas utilizando AlphaFold.
- Análisis y predicción de Interacciones proteína-proteína y proteína-ligando utilizando IntAct, AlphaFold3 y Boltz.
- Proteínas desordenadas - conceptos teóricos y análisis experimental.
- Predicción de desorden y otras propiedades de secuencia.
- Motivos Lineales: Estudio experimental e Identificación en secuencia.
- Diseño de novo de proteínas utilizando herramientas de inteligencia artificial.
Programa Práctico resumido
- Bases de Datos de Proteínas: Uniprot (Swissprot, Trembl), Interpro, PDB, PFAM.
- Visualización de Proteínas en ChimeraX.
- Modelado Estructural: HHPred y AlphaFold.
- Predicción de interacciones proteína-proteína y proteína-ligando utilizando AlphaFold3 y Boltz.
- Análisis de alineamientos múltiples de secuencias utilizando Jalview.
- Predicción de desorden: IUPred y otros predictores.
- Predicción de regiones de baja complejidad, separación de fases, agregación, TMHMM, Coiled-coiled.
- Bases de Datos de Proteínas Desordenadas: PED, DISPROT, MOBIdb, PhasePro.
- Motivos Lineales: Conceptos de Expresión Regular e identificación en alineamientos.
- Base de Datos de Motivos Lineales: ELMdb.
- Diseño de novo de proteínas utilizando RF Diffusion y Protein MPNN.