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Contenidos

Programas

Programa Teórico resumido

  • Bases de Datos de Proteínas: Uniprot (Swissprot, Trembl), Interpro, PDB, PFAM.
  • Estructura de Proteínas y relaciones estructura-función.
  • Modelado por Homología y predicción de la estructura de proteínas utilizando AlphaFold.
  • Análisis y predicción de Interacciones proteína-proteína y proteína-ligando utilizando IntAct, AlphaFold3 y Boltz.
  • Proteínas desordenadas - conceptos teóricos y análisis experimental.
  • Predicción de desorden y otras propiedades de secuencia.
  • Motivos Lineales: Estudio experimental e Identificación en secuencia.
  • Diseño de novo de proteínas utilizando herramientas de inteligencia artificial.

Programa Práctico resumido

  • Bases de Datos de Proteínas: Uniprot (Swissprot, Trembl), Interpro, PDB, PFAM.
  • Visualización de Proteínas en ChimeraX.
  • Modelado Estructural: HHPred y AlphaFold.
  • Predicción de interacciones proteína-proteína y proteína-ligando utilizando AlphaFold3 y Boltz.
  • Análisis de alineamientos múltiples de secuencias utilizando Jalview.
  • Predicción de desorden: IUPred y otros predictores.
  • Predicción de regiones de baja complejidad, separación de fases, agregación, TMHMM, Coiled-coiled.
  • Bases de Datos de Proteínas Desordenadas: PED, DISPROT, MOBIdb, PhasePro.
  • Motivos Lineales: Conceptos de Expresión Regular e identificación en alineamientos.
  • Base de Datos de Motivos Lineales: ELMdb.
  • Diseño de novo de proteínas utilizando RF Diffusion y Protein MPNN.