Teórica 3

Búsquedas de secuencias en bases de datos: estadística

Continuación de la clase teórica de algoritmos heurísticos de búsqueda de secuencias similares en bases de datos.

• Slides
• Clase grabada en 2023
• Clase dictada virtual por paro docente Sesion Zoom grabada

Material de lectura y consulta

• Needleman SB, Wunsch CD. (1970) A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequence of two proteins. J Mol Biol.48: 443-53.
• Selecting the Right Similarity-Scoring Matrix. Pearson, W. R. (2013) Curr. Prot. Bioinformatics Chapter 3: Unit 3.5
• Sequence alignment
• Having a BLAST with bioinformatics (and avoiding BLASTphemy). Pertsemlidis, A., Fondon, J.W. (2001) Genome Biol 2, reviews2002.1
• Selecting the Right Similarity-Scoring Matrix. Pearson, W. R. (2013) Curr. Prot. Bioinformatics Chapter 3: Unit 3.5
• An Introduction to Similarity ("Homology") Searching. Pearson, W. R. (2013) Curr. Prot. Bioinformatics Chapter 3: Unit 3.1